皮屑芽孢菌最早是在1904年由頭皮屑中所發現，Raymond Sabouraud稱為Pityrosporum malassez。由於培養不易，一直到了1996年Geuho & Midgley以特殊培養基(Dixon)發現了共7種皮屑芽孢菌，才有了突破。目前通過基因研究，國際上已命名14種

M. furfur
M. obtusa
M. globosa
M. slooffiae
M. sympodialis
M. restricta
M. dermatis
M. japonica
M. nana
M. yamatoensisþ 
M. equina 
M. caprae 
M. cuniculi
M. pachydermatis